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Dans le menu Actions, la commande Supprimer supprime les fichiers et les dossiers sélectionnés pour un ou pour les deux côtés de la comparaison. Si un dossier est sélectionné, seul son contenu filtré sera supprimé (identiquement comme si le dossier était développé et tout son contenu visible sélectionné). Toutefois, si un dossier ouvert est sélectionné et que n'importe lequel de ses enfants est également sélectionné, alors la sélection du dossier est ignorée et seuls les enfants sélectionnés seront supprimés. Cochez Utiliser la corbeille si possible pour déplacer les fichiers et les dossiers stockés sur le disque local vers la corbeille au lieu de les enlever complètement. Cette option est ignorée pour les suppressions des disques réseaux, pour les services distants et dans les fichiers archives.